Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2e3P52483 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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