Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pold1P52431 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms