Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms