Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms