Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfP51642 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfP51642 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfP51642 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfP51642 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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