Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms