Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TspoP50637 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TspoP50637 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TspoP50637 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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TspoP50637 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TspoP50637 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TspoP50637 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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TspoP50637 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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