Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt6aP50446 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms