Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms