Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtpreP49446 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PtpreP49446 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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