Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hnrnpa1P49312 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms