Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms