Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms