Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CratP47934 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CratP47934 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CratP47934 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CratP47934 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CratP47934 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CratP47934 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CratP47934 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CratP47934 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CratP47934 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms