Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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