Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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