Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ThpoP40226 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms