Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fen1P39749 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms