Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lig1P37913 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms