Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab20P35295 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms