Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab17P35292 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms