Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms