Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms