Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms