Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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