Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc1P29341 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms