Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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