Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Marcksl1P28667 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms