Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms