Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms