Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms