Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms