Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms