Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nfkb1P25799 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms