Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd247P24161 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd247P24161 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd247P24161 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms