Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms