Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmnb2P21619 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms