Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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