Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P20040 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P20040 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms