Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms