Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RargP18911 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RargP18911 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RargP18911 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RargP18911 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RargP18911 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RargP18911 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RargP18911 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RargP18911 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RargP18911 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms