Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms