Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18533 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18533 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18533 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P18533 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms