Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa-rs2P17534 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs2P17534 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms