Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou4f1P17208 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms