Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms