Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms