Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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