Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calb1P12658 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms