Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DmdP11531 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DmdP11531 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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DmdP11531 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DmdP11531 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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DmdP11531 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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DmdP11531 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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DmdP11531 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DmdP11531 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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